Les chevaux portent deux types de pigments majeurs, qui effectuent la couleur du pelage. Les couleurs primaires sont soit foncés (noir ou bai) soit jaune. La grande variation des couleurs parmi les différentes races de chevaux est défini par des gènes, qui contrôlent la quantité, l’intensité et la distribution par les deux pigments.
 
« Alezan » :
La mutation sur le gène McR1 est responsable pour la production de phéomélanine, qui donne la couleur « Alezan » (e/e). Cette mutation se transmet héréditairement sur le mode autosomique récessif. Si la mutation est présente avec une seule copie (E/e) oubien pas du tout (E/E), le pigment eumélanine sera produit. Le cheval porte la robe bai oubien noir.
 
« Noir / Bai » :
La distribution du pigment noir est défini par le gène « agouti » (a). Ce gène n’a aucune influence pour la couleur de la robe chez les alezans.
Mais le gène agouti « caché » chez les alezans, joue un rôle important dans l’élevage. Si le cheval n’est pas « alezan » et si le gène « agouti » est présent dans la forme récessif homozygote (génotype E/e oubien E/E ; a/a), le pigment noir sera distribué dans tout le corps et le cheval est « Noir ». Si le gène « agouti » est présent dans la forme récessif hétérozygote (génotype E/e oubien E/E ; A/a) oubien la forme est absolument absente (génotype E/e oubien E/E ; A/A ), le pigment noir sera seulement présent dans quelques parties de la robe, comme par ex. dans la crinière et la queue.
 
« Crème » (dilution) :
Un autre gène, le MATP, provoque - dépendant de la couleur primaire - une coloration « Crème » (c) différente de la robe du cheval (une dilution de la couleur primaire) . Les chevaux, qui ne portent pas ce gène (C/C) porte la couleur « Alezan », « Bai » oubien « Noir ». Les « Alezans » hétérozygotes, du génotype (e/e ; C/c) deviennent des « Palominos » (Isabelle), les « Bais »hétérozygotes du génotype (E/e ; oubien E/E ;A/A oubien A/a ; C/c) deviennent des « Fauves » et les « Noirs »hétérozygotes du génotype (E/e oubien E/E ; a/a, C/c) deviennent des « bais brun ».
 
Les « Alezans » homozygotes, du génotype (e/e ; c/c) deviennent des « Cremellos », les « Bais » du génotype (E/e oubien E/E ; A/A oubien A/a ; c/c) deviennent des « Perlinos » et les « Noirs » du génotype (E/e oubien E/E ; a/a ; c/c) deviennent des « fauves ».
 
« Tobiano »
Le « Tobiano » est défini comme coloration pie la plus fréquente chez les chevaux. Les taches de ces chevaux ont des bordures claires et une démarcation claire.
Les yeux sont normalement foncées. Les « Tobianos » ont souvent des membres blancs au moins jusqu’au genoux / jarrets.
Les signes de la tête sont similaires aux chevaux sans coloration « Tobiano ». Les taches blanches traversent normalement au moins une fois la médiane du dos. La manifestation des taches blanches est très variable.
 
Les taches sont présentes à cause du manque de cellules qui produisent le pigment (mélanocytes) à ces endroits.
 
Comment interpréter le résultat ?
L’héritage de la coloration « Alezan » :
Si le cheval a le génotype (homozygote e/e), il empreinte le phénotype « Alezan » et il ne transmet que « Alezan » à ces descendants. Lors d’un accouplement avec un cheval, qui ne porte aucun gène pour « Alezan » (E/E), les descendants ne serront jamais des « Alezans». Tous ces descendants ont le génotype (hétérozygote E/e) et ils sont « porteurs» pour la coloration « Alezan ». Lors d’un accouplement d’un cheval hétérozygote (E/e) avec un autre cheval hétérozygote (E/e) oubien avec un « Alezan » homozygote (e/e), les descendants peuvent également être « Alezans ». Si le cheval ne porte pas de gène pour « Alezan » (homozygote E/E), il n’a jamais de descendants pour cette robe « Alezan », même s’il s’accouple avec un cheval hétérozygote (E/e). De cet accouplement cependant, 50% des descendants sont des chevaux hétérozygotes (E/e).
 
L’héritage de la robe « Noir » :
La couleur bai oubien noir de la robe s’exprime seulement, si le cheval ne porte pas le génotype pour « Alezan » (homozygote E/E) oubien le génotype hétérozygote (E/e). La coloration noir oubien bai dépend du gène « Agouti ». Si cette allèle récessive est présente dans sa forme homozygote (a/a), la couleur de la robe est « Noire». Si le cheval a le génotype (A/a ; hétérozygote pour « Bai ») oubien le génotype (A/A ; homozygote pour « Bai »), la robe est de couleur « Bai » avec la crinière et la queue noir. Les résultats des différents accouplements consistent aux mêmes règles que la couleur « Alezan ». On doit se rendre compte du gène « Agouti » lors du gène caché chez les « Alezans ».
 
L’héritage du gène « Crème » (dilution) :
Dépendant de la couleur primaire, qui sont déterminées par les gènes « Mc1R » et « Agouti », les nuances sont exprimées par ce gène « C », comme décrit ci-dessus. L’héritage chez les différents accouplements et le même processus comme décrit au-paravent chez les « Alezans ». Nous testons spécifiquement la mutation dans le gène MATP, qui est responsable pour les différentes colorations de « Crème ». D’autres gènes oubien d’autres mutations, qui déterminent les couleurs du pelage similaires, ne sont pas prouvés avec ce test.
 
L’héritage de « Tobiano » :
A l’aide d’un test ADN, le marqueur, associé à la coloration de « Tobiano » (KM1-allèle) peut être prouvé. En associant la coloration « Tobiano » avec l’allèle «KM1 », les races « Tinker », « Paint » et « Pinto » sont prouvés.
 
Dans certain cas, le marqueur peut être déchaînée du gène « Tobiano », ca veut dire, que la coloration « Tobiano » peut être exprimé indépendamment de l’allèle « KM1 ».
Les taches caractéristiques pour la coloration de « Tobiano » se transmettent héréditairement sur le mode autosomique dominant. La coloration de « Tobiano » est exprimé, si le marqueur « KM1 » est présent soit sous la forme homozygote soit sous la forme hétérozygote.